Identifying metal-binding small biological molecules

Ko te whakatauira i nga tikanga ahupūngao ka awhina i nga kairangahau ki te kimi i nga here whakarewa

Kua whakawhanakehia e nga kairangahau he tikanga mo te tautuhi i nga ngota ngota iti e herea ana nga katote whakarewa.He mea nui nga katote whakarewa i roto i te koiora.Engari ko te tautuhi ko tehea ngota ngota—a koa ko tehea ngota ngota iti—he mea uaua te taunekeneke ki aua katote whakarewa.

Hei wehe i nga metabolites mo te tātari, ka whakamahia e nga tikanga metabolomics nga whakarewa pararopi me nga pH iti, ka taea te wehe i nga matatini whakarewa.I pirangi a Pieter C. Dorrestein o te Whare Wananga o California San Diego me ona hoa mahi ki te pupuri i nga matatini mo te wetewete ma te whakatauira i nga tikanga taketake kei roto i nga ruma.Engari ki te whakamahia e ratou nga tikanga aa-tinana i te wa e wehea ai nga ngota ngota, me arotau ano nga tikanga wehenga mo ia ahuatanga tinana e hiahia ana ratou ki te whakamatautau.

Engari, i whakawhanakehia e nga kairangahau he huarahi e rua-waahanga e whakaatu ana i nga tikanga whaiaroaro i waenga i te wehenga chromatographic tikanga me te tātaritanga spectrometric papatipu (Nat. Chem. 2021, DOI: 10.1038/s41557-021-00803-1).Tuatahi, ka wehea e ratou he tangohanga koiora ma te whakamahi i te chromatography wai mahi teitei.Kātahi ka whakatikahia e rātou te pH o te rere e puta ana i te tīwae chromatographic ki te whakatauira i ngā āhuatanga ahupūngao, tāpiri katote konganuku, ka tātarihia te ranunga ki te spectrometry papatipu.E rua nga wa i whakahaerea e ratou te tātaritanga kia whiwhi i te hihinga papatipu o nga ngota ngota iti me nga konganuku me te kore.Hei tautuhi ko tehea ngota ngota e herea ana i nga konganuku, i whakamahia e ratou he tikanga rorohiko e whakamahi ana i nga ahua o te tihi ki te whakatau i nga hononga i waenga i te hihinga o nga putanga here me te kore here.

Ko tetahi huarahi ki te whai i nga ahuatanga o te tinana, e kii ana a Dorrestein, ko te taapiri i nga kukū teitei o nga katote penei i te konutai, te pāhare pāporo ranei, me te iti o te kukū o te whakarewa."Ka waiho hei whakamatautau whakataetae.Ko te tikanga ka kii atu ki a koe, OK, ko tenei ngota i raro i enei ahuatanga he kaha ake ki te here i te konutai me te pāhare pāporo, ko tenei whakarewa motuhake ranei kua taapirihia e koe, "e kii ana a Dorrestein."Ka taea e taatau te whakauru i nga momo konganuku rereke i te wa kotahi, ka tino marama taatau ki te hiahia me te whiriwhiringa i roto i taua horopaki."

I roto i nga tangohanga ahurea mai i te Escherichia coli, i tautuhia e nga kairangahau nga puhui here rino e mohiotia ana penei i te yersiniabactin me te aerobactin.Mo te yersiniabactin, i kitea ka taea e ia te here i te zinc.

I tautuhia e nga kairangahau nga pūhui here-whakarewa i roto i nga tauira he uaua ano te maaota waro kua memeha mai i te moana."Koinei tetahi o nga tauira tino uaua kua tirohia e ahau," ta Dorrestein."He uaua ano pea, penei me te mea he uaua ake i te hinu hinu."I tautuhia e te tikanga ko te waikawa domoic he ngota ngota konukura herea me te whakaaro ka herea te Cu2+ hei dimer.

"Ko te huarahi omics ki te tautuhi i nga metabolites here katoa i roto i te tauira he mea tino whai hua na te mea nui o te chelation whakarewa koiora," ka tuhi a Oliver Baars, e rangahau ana i nga metabolites here-metara i hangaia e nga tipu me nga moroiti i Te Whare Wananga o North Carolina State University, i tuhia i roto i te īmēra.

"Ka whakaratohia e Dorrestein me nga hoa mahi he whakamatautau huatau, e hiahiatia ana, kia pai ake te tirotiro he aha te mahi a-tinana o nga katote whakarewa i roto i te pūtau," ka tuhi a Albert JR Heck, he pionia i roto i nga tātaritanga o te iwi taketake i te Whare Wananga o Utrecht, i roto i te imeera."Ko tetahi mahi ka whai ake ko te tango i nga metabolites i raro i nga ahuatanga taketake mai i te pūtau me te wehewehe i enei i raro i nga tikanga taketake, kia kite ko wai nga metabolites e kawe ana i nga katote whakarewa pūtau mutunga."

Wā tuku: Tihema-23-2021